喃东尼 中国BIGD跻身国际生物组学数据库

BIGD是通过建立中国人自己的组学数据库，利用自己的巨轮打开它而产生的。南东尼绘画

随着测序技术的发展，生命科学领域已经进入组学时代，海量数据输出成为常态。基因组学是对基因、蛋白质、代谢物等生物分子作为一个整体的系统研究，基因组学、蛋白质组学、代谢组学也相应产生。与以往对个体的研究相比，组学最重要的特点是大数据。随着组学数据的输出，建立组学数据库，实现海量信息的存储、集成和共享是一项重要的任务。

目前，国际公认的生物医学数据中心主要包括美洲的NCBI、欧洲的EBI和日本的DDBJ。如果你想在国际期刊上发表论文，你需要将你的原始数据提交给这三个官方指定的数据库。这种情况表面上有利于国际科学数据资源的整合和共享，但实际上对我国科研的发展影响很大:不仅影响数据提交的效率，更重要的是下载数据时会遇到各种限制，中国科学家永远做不到自己数据的主人。

占世界数据输出40%左右的中国是一个数据输出大国，但没有国际公认的数据库系统，不得不将自己宝贵的数据资源托付给他人。

现在，这种情况终于改变了。近日，中国科学院北京基因组研究所生命健康大数据中心团队在国际学术期刊《核酸研究》网上发表了一篇研究论文，题为《北京基因组研究所生命健康大数据中心:从存储到整合到转化》。生命健康大数据中心张章研究员、高级工程师、肖景发研究员是本文的合著者。这是中国首次以数据中心模式发布中国生命组学数据资源建设，标志着中国生命健康大数据中心建设取得实质性进展，也标志着中国全面基因组数据资源建设得到国际同行认可。

北京基因组研究所生命健康大数据中心BIGD肩负着构建面向国家大数据发展战略的多层次生物基因组学数据资源体系的重要历史使命。目前，数据资源系统包括:高通量测序中的原始组学数据档案数据库GSA、围绕国家重要战略生物资源的基因组数据库GWH、基于测序数据的基因表达数据库GEN、基于中国人群和国家重要物种群的基因组变异数据库GVM、基于全基因组DNA甲基化图谱的表观基因组数据库MethBank。而基于公众点评的生命科学wiki知识库Science Wikis，在国内已经初步形成了一个生命健康数据的会议和共享平台，拥有一个可以服务全球的基因组数据共享网络。该研究得到了中国科学院战略科技试点项目和中国科学院国际科学计划的支持。

现在，包括《国家科学院院刊》、《细胞研究》等核心期刊在内的许多国际核心期刊都已批准向BIGD提交数据，我国原组学数据库BIGD已成为继三大国际数据中心之后第四个获得国际认可的数据库。