中华绒螯蟹 中华绒螯蟹转录组测序（三）

简介:

中华绒螯蟹是一种经济蟹，又名河蟹、大闸蟹、清水蟹、大闸蟹，长期以来是我国的名菜。我国南北沿海湖泊分布广泛，其中长江系统产量最大，螃蟹含维生素A较多，有助于皮肤角质化；对儿童佝偻病和老年人骨质疏松症也有补钙作用。雄性和雌性中华绒螯蟹的基因表达存在差异。为了探索中华绒螯蟹性别偏向基因的表达，对雌雄中华绒螯蟹的转录组进行了测序，以探讨性别偏向基因的表达差异和雌雄同体的分子机制。

以中华绒螯蟹为例，海洋生物转录组的测序情况如何？中国科学院海洋研究所的刘源教授和她的团队对中华绒螯蟹雌雄样本的转录组进行了测序。结果表明，共鉴定出148个性别相关基因，检测出29条性别决定途径，不同性别差异表达基因与代谢和免疫相关。也证实了男女个体在某些性别相关基因的表达上存在显著差异，不同基因大多参与代谢和免疫，但与性功能关系不明显。

在免疫途径的差异基因中，女性个体中有18个上调基因是由体液免疫因子引起的，男性个体中有8个上调的差异基因位于模式识别受体上，表明中华绒螯蟹在免疫防御方面可能存在性别差异。本研究将为进一步研究中华绒螯蟹雌雄同体提供分子机制。这项研究结果，比较染色体分析揭示了中华绒螯蟹幼蟹性别偏向的基因表达，最近发表在《公共科学图书馆综合》杂志上。

中华绒螯蟹转录组测序和信息分析由上海派特诺生物技术有限公司完成，也是我公司完成的第二篇中华绒螯蟹文章。

方法:

中华绒螯蟹雌雄个体

样本量:

2个样本

测序平台:

质子平台

分析内容:

1.单核苷酸多态性分析

2.GO评论

3.特定代谢途径的分析

4.qPCR验证

结果:

共验证了148个性别相关基因，检测到29条性别决定途径，不同性别差异表达基因与代谢和免疫相关。已经证实，在男性和女性个体之间，一些性别相关基因的表达存在显著差异。

一些结果表明:

图1 SNP基因座分析

图2溶酶体代谢途径中基因表达的差异分析

分析

图3差异表达基因GO注释

引用

敏慧·刘源。比较染色体分析揭示中华绒螯蟹幼蟹性别偏向的基因表达。PLoS One。(2015)1-21.