据天津发布的消息,11月8日,天津市疾控中心对天津市第138例本地确诊病例的呼吸道标本及相关冷藏环境标本进行了涂片,并对SARS-CoV-2进行了全基因组高通量测序和序列分析。
9天测序分析表明,该菌株与3-6月间在北美流行的菌株高度相似,属于L基因型欧洲家系二分支(北美分支)。
11月7日晚,山东省德州市通报,某水产商店从天津口岸进口的一批冷冻猪肉,在进口冷链食品常规抽检中发现核酸检测呈阳性。
8日凌晨2点,天津市防控指挥部报告称,一名装卸工人核酸检测呈阳性,已被送往指定医院治疗。新冠肺炎第138例确诊病例,男,38岁,住天津市中心生态城,天津海联冷冻食品有限公司装卸工人..
发病前14天,患者有接触进口冷链食品史,无外出史,毫无疑问,类似于病例和确诊病例的接触史,无接触发热或呼吸道症状。11月4日,患者参与进口冷冻食品的处理。
中国科学院主办的《国家科学评论》3月3日发表的论文《论SARS-CoV-2的起源和持续进化》中,新型冠状病毒分为两种基因型,S基因型相对温和,约占30%;l基因型传染性强,约占70%,这两种基因型在武汉均有发现。其中L基因型有欧洲科的I分支,3、4月份在欧洲流行的病毒株后来传播到南美等地。
《北京日报》客户记者注意到,中国疾病预防控制中心7月10日发布消息称,北京52例确诊病例SARS-CoV-2全基因组高通量测序结果和新发地市场8份环境样品显示,所有样品均符合L基因型欧洲家系分支I基因位点突变特征。
在SARS-CoV-2中高通量测序了北京新发地市场8份环境样品的全基因组。结果表明,52份新冠肺炎病患者标本的全基因组序列在7个位点有相同的突变:C241T、C3037T、C14408T、A23403G、GGG28881-28883AAC,属于L基因型欧洲家系I分支..
根据流行病学调查和病毒基因测序结果分析,造成北京疫情的病毒株为L基因型欧洲家系一科,排除了动物病毒外溢感染人的可能性。
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