mngs 疑难病原体检测快、准、狠——我院呼吸内科开展“纤支镜下肺泡灌洗送检mNGS高通量测序”新技术

　　每当季节交替，天气变凉，是呼吸系统疾病高发期，引起呼吸道感染的病原体复杂多样，明确引起感染的病原体是科学有效治疗呼吸道疾病的前提。传统的痰涂片找细菌的方法阳性率较低，大概20%～30%，我科采取纤支镜肺泡灌洗液送检mNGS的方法，阳性率90%左右，明显提高了阳性率及准确率，更好的指导临床治疗。

一、病例介绍

病例1：男性患者，76岁，脑梗塞后长期卧床，在我院神经内科住院期间出现咳嗽、咳痰、发热、呼吸困难，胸部CT提示肺部感染，给予抗生素输液治疗半月，症状稍有缓解，仍反复低热，复查胸部CT提示肺部感染吸收不明显，请呼吸科会诊后行纤支镜肺泡灌洗，灌洗液送检行mNGS检查，mNGS检查结果提示链球菌、单纯疱疹病毒，根据mNGS结果调整抗生素，3天后患者热退，症状明显缓解，10天后复查胸部CT肺部感染明显吸收，痊愈出院，出院诊断：链球菌肺炎、单纯疱疹病毒性肺炎。

病例2：男性患者，49岁，咳嗽、咳痰、发热，胸部CT提示肺部感染，入院后给予抗生素输液治疗1周，症状无明显缓解，仍反复发热，复查胸部CT提示肺部感染吸收不明显，积极与家属沟通后行纤支镜肺泡灌洗，灌洗液送检行mNGS检查提示克雷伯菌属，根据mNGS结果调整抗生素，1周后患者无发热，咳嗽咳痰明显缓解，10天后复查胸部CT提示肺部感染明显吸收，痊愈出院，出院诊断：克雷伯菌肺炎。

二、宏基因组二代测序（mNGS）

1.宏基因组二代测序（mNGS），这种检测方法是不基于培养，直接从环境/临床样品中提取全部微生物的DNA, 利用基因组学的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。这是一种可广泛分析临床样本微生物组（细菌，真菌，病毒）的高通量测序方法。

2.宏基因组二代测序，通过取样，核酸提取并建库，然后测序，显著提高病原检测的敏感度，缩短了检测时间，对罕见病原体感染的诊断具有优势，可用于临床疑难感染病原体检测，比传统培养拥有更高的敏感性。

3.一般3～5个工作日可以获得分析报告，自费3600元；加测RNA病毒，加1200元。

丹江口市第一医院呼吸内科

2020.10.15