在线工具 48个实用的生信在线工具

在线工具一般都具有“功能强大，操作简单，不用安装，用了就跑”的特点，很容易实现“用别人的服务器分析自己的数据”。之前我们在吉迪恩Bio的微信官方账号分享了盛鑫常用的32款在线工具，非常受欢迎。这里我们再加16个。

基因结构作图

1.外显子-内含子图形标记

工具链接:

http://www.wormweb.org/exonintron

核糖核酸的二级结构

2.Mfold

工具链接:

http://unafold.rna.albany.edu/? q = mfold

3.RNAfold

工具链接:

http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi

蛋白质相互作用网络

4.线

工具链接:

https://string-db.org/

基因共表达网络

5.Coexpedia:

工具链接:

http://www.coexpedia.org/

序列基序

6.文化基因

工具链接:

http://meme-suite.org/

7.Weblogo

工具链接:

http://weblogo.threeplusone.com/

基因信息搜索

8.基因卡

工具链接:

http://www.genecards.org

顺序显示

9.电子脚本:

工具链接:

http://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi

基因识别转化

10.生物艺术

工具链接:

http://www.ensembl.org/index.html

11.g:profiler

工具链接:

https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/convert

12.单一端口检索/标识映射

工具链接:

https://www.uniprot.org/uploadlists/

13.bioDBnet

工具链接:

https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/

韦恩图

14.Venny2.0

工具链接:

http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

15.OmicShare Wayne图表工具

工具链接:

http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/venn

三元图

16.三元绘图器

工具链接:

https://www.ternaryplot.com/

基因结构分析

17.FGENES

工具链接:

http://softberry.com/

样本结果:

系统发育分析

18.iTOL

工具链接:

https://itol.embl.de/

19.Evolview

工具链接:

http://www.evolgenius.info/evolview/

启动子预测

20.启动子扫描

工具链接:

http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

蛋白质一级结构预测

21.PredictProte

工具链接:

https://www.predictprotein.org/home

22.ProtParam工具

工具链接:

http://web.expasy.org/protparam/

信号肽预测

23.信号p

工具链接:

http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

跨膜区

24.TMHMM服务器v. 2.0

工具链接:

http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

亚细胞定位

25.PSORT

工具链接:

https://www.psort.org/

蛋白质三级结构预测

26.瑞士模型

工具链接:

https://swissmodel.expasy.org/

27.Phyre2

工具链接:

http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi? id =索引

短序列拼接

28.Cap3

工具链接:

http://doua.prabi.fr/software/cap3

GO富集分析

29.omicshare go的富集分析工具

工具链接:

http://www.omicshare.com/tools/home/report/goenrich.html

KEGG浓缩分析

30.OmicShare KEGG浓缩分析工具

工具链接:

http://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html

趋势分析

31.OmicShare趋势分析工具

工具链接:

http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/trend

蛋白质结构域预测

32.Pfam

工具链接:

http://pfam.xfam.org/search

33.聪明的

工具链接:

http://smart.embl-heidelberg.de/

基因组杂合性的评估

34.基因镜

工具链接:

http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?代码=示例2

圆形图

35.CIRCOS

工具链接:

http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

36.热图

Omicshare热图工具

工具链接:

http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/heatmap

注释工具

37.Omicshare注释工具

工具链接:

https://www . omicshare . com/tools/Home/Soft/getSoft/type/annotation

细胞标记

38.CellMarker

工具链接:

http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/index.jsp

CircRNA数据库

circRNA

39.circBase

工具链接:

http://www.circbase.org/

40.循环儿科

工具链接:

http://www.picb.ac.cn/rnomics/circpedia/

小核糖核酸

41.deepBase

工具链接:

http://rna.sysu.edu.cn/deepBase/

42.sRNAanno

工具链接:

www.plantsRNAs.org

长链非编码

43.TANRIC

工具链接:

http://bioinformatics.mdanderson.org/main/TANRIC:Overview

44.非编码

工具链接:

http://www.noncode.org/

姓

45.starBase

工具链接:

http://rna.sysu.edu.cn/deepBase/

46.微型海绵

工具链接:

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/miRSponge/

序列翻译

47.翻译工具

工具链接:

https://web.expasy.org/translate/

48.ORFfinder

工具链接:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

最后，除了缺乏针对个别工具的详细教程外，以上工具的详细教程大部分都可以通过Guidio Bio微信微信官方账号菜单栏中的“搜索号码”进行搜索。嗯，分享给朋友圈吧~

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