1.三维分子
观察生物分子的三维微观立体结构
RasTop:RasMoL 2 . 7 . 1的图形用户界面软件
编钟:直接在浏览器中观看3D分子
molMol:pdb格式的蛋白质文件经过微调并保存为一个普通的图形文件
拉斯摩尔(win)2.7.0.1拉斯摩尔新版和中文版
水晶信息:用于快速简便地构建、观察和检查晶体三维结构
pdviewer:pdb格式文件的查看器
Weblab Viewlite:三维分子浏览工具及大量分子文件实例
Weblab ViewerPro:三维分子浏览工具
ICMLite:一个三维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能
VMD:三维分子浏览工具,可以动态显示
Cn3d: 3d分子结构观察软件
PDB文件检索显示分析软件
DTMM:显示、编辑和构建三维分子模型的程序
Mole:显示和计算高分子三维图形的高性能工具
Gopenmol:显示和分析分子结构及其特征
生成三维图像的工具软件
莫尔波夫:将PDB文件转换成波夫格式文件的软件
Mol2Mol:分子文件格式转换软件
视点转换:将PDB文件转换为视点格式文件
视窗奥尔特普-3:生成分子的热椭圆点图
一个通用晶体学软件工具
Mage:阅读和演示Kinemage格式文件的专用软件
Prekin:将PDB格式文件转换为Kinemage格式文件
瑞士-pdb浏览器:pdb文件显示和分析软件
DINAMO:对蛋白质序列进行排队、比较和编辑以及建立三维模型的工具
PCMoleeule2 Lite:查看PDB格式文件的免费软件
化学分子编辑和三维模型生成软件
JMVC:用JAVA技术编写的三维分子观察器
阅读和分析XYZ格式的三维分子文件
Oscar il:用于处理、定义和检查小分子单晶的软件包
分子构建和观察软件
tinker:DOS下分子设计建模配合Moilin
生物设计:自由分子建模和显示软件
MoluCAD:功能齐全的分子建模和显示工具软件
查看器控件:3D分子显示控件
MarvinView:用JAVA语言编写的化学分子的Java二维和三维显示程序
用于ISIS的ACD/3D查看器:免费ISIS 3D显示插件
阿米拉:先进的3D显示建模系统
AmiraMol:Amira 2.3显示三维分子的相应增强工具
可视化:分子建模和研究软件包
ScientificGL:C OpenGLAPI API三维分子开发工具
Sojourner:一个软件,它能找出小蛋白质的最小能量结构,并实时演示它们
2.核糖核酸分析
RNAdraw:RNA二级结构分析软件
核糖核酸结构:预测核糖核酸水平结构图
核糖核酸二级结构绘图程序
3.蛋白质分析
蛋白质序列分析软件包
蛋白质序列分析软件包
观察和编辑螺旋膜蛋白拓扑结构的软件
一个免费的多功能蛋白质分析软件包
4.生化教学
各种生化代谢途径以图表的形式呈现
Linpath.:线性酶反应模拟软件
蛋白质纯化模拟软件
MOLMED。生物化学基本概念演示教学计划
生物化学:生物化学教学文件
图片:光合作用教学程序
肾上腺素:肾上腺素在肝糖原代谢中作用的证明
虚拟细胞实验室:细胞生物学多媒体教学方案
5.生化工程
Brd.:生物反应器(发酵罐)设计软件
BioStat:BioStatB发酵罐控制程序
青霉素发酵模拟软件
生物松香:发酵实时模拟软件
6.序列格式转换
Vised:串行输入分析和格式转换软件
多序列文件格式转换软件
序列格式转换软件
基因工作室乐版:用于显示、编辑和转换序列格式的工具软件
FASTA/BLAST SCAN:FASTA和BLAST查询输出文件的处理软件
串行格式转换软件
7.引物分析
初级读本5.0:初级读本设计工具
Oligo:著名的引物分析软件
引物设计器:用pask-IBA ~ PPR-IBA表达载体专门设计的免费引物设计辅助软件
阵列设计器:批量设计脱氧核糖核酸和寡核苷酸引物的工具
信标设计器:聚合酶链反应定量分析分子信标设计软件
基于网络界面的引物设计程序
8.综合序列分析
Pcgene:分子生物学应用软件
MACAW:多序列构建与分析软件
一个用于核酸和蛋白质序列多序列比较的软件
clustalx:clustalwindows接口程序
在数据库中搜索同源序列的软件
基因文档:对序列和其他操作进行相关性分析
BLAST和Blastcl3:用于在数据库中搜索相似序列的软件和客户端软件
SeqPup 0.9:用于编辑和分析生物分子序列的软件
K-Estimator 5.5:进化遗传学研究软件,评估两个核酸序列的核苷酸取代数
生物编辑:序列编辑器和分析工具软件
综合排序工具软件
激光基因:综合测序工具软件
图形化多序列队列编辑器
Jalview:用Java语言编写的多序列队列编辑器
DNASIS:综合序列分析工具
基因表达:这是一个脱氧核糖核酸和蛋白质序列分析的工具
矢量视窗:矢量视窗软件
水母:多功能序列分析软件
ProSeq:核酸序列编辑和群体遗传分析软件
Gap4数据库浏览器:读取和显示gap4基因组装数据库的软件
短信:脱氧核糖核酸收集在线工具的脱氧核糖核酸和蛋白质序列分析和格式化
Omiga:核酸和蛋白质序列的综合分析软件
Staden:集成序列分析工具软件包
载体试剂盒:全面的蛋白质核酸分析试剂盒
Inca: BLAST服务器客户端程序用INCA:Java脚本语言编写
Isys:由Isys开发的一个软件收集平台,用于收集用JAVA语言编写的几种不同的生物信息学软件和数据库
脱氧核糖核酸或:脱氧核糖核酸和蛋白质序列的综合分析软件
序列快速计算器:一个非常紧凑的分子生物学工具软件
系统学家:用于显示基因和蛋白质序列之间进化关系的软件,类似于研究
9.进化树分析
Phylip:进化树分析软件,可以画进化树
进化树处理软件
基因树:一个用系统发生树比较基因的程序
NDE:用于编辑NEXUS格式文件的程序
树形图:用于直观比较主进化树和从进化树的程序
光谱:分析进化信息而不将其转化为进化树的软件
进化工具:计算和处理进化树数据的软件
树难题:核酸序列和蛋白质序列相似性分析和进化树构建的工具
亚视:用Java语言编写的进化树文件软件,显示“新罕布什尔”和NHX格式
TREECON:构建和绘制进化树的软件包
ProBiosys:比较表型分类数据,分析计算核酸序列数据距离值的软件
10、质粒图谱
质粒处理器:绘制质粒图谱的软件
质粒处理器:绘制质粒图谱的软件,和血浆处理器是同一作者
WinPlas:质粒图谱软件商业版
DMUP:圆形质粒图谱软件的测试版
质粒工具包:质粒绘图软件
PDRAW:DNA分析与作图软件,可以绘制线性或圆形的DNA图谱
Redasoft可视化克隆:是著名的绘制质粒图谱的Redasoft质粒1.1软件的升级版
质粒绘图软件
11.图像处理
图像工具:用于科学目的的图像处理软件
Image J:用Java语言编写的科学图像处理软件
交叉检验器:基因指纹分析软件
ALF map:ALF map:ALF(Amersham Pharmacia)图像格式转换软件
乐队领队:凝胶图像处理软件
接穗图像:一种图像处理和分析工具
通用医学图像处理和分析软件
Melanie 3查看器:免费的Melanie图像查看器
智能绘图:流程图绘图软件演示版
图像处理免费软件
比较两幅图像异同的软件
带宽扫描:蛋白质凝胶电泳图像分析软件
SigmaScanPro: 30天全功能演示版图像分析软件
凝胶图像分析软件
图像分析软件
标签图像:凝胶图像分析软件
用于定量比较两幅2D凝胶图像之间差异的软件
Timediff:用于分析蛋白质/基因表达图谱时间序列的JAVA软件
定量扫描:使用简单实用的凝胶扫描和分析软件
PDQuest:分析二维凝胶和生成数据库的标准软件
12.数据处理
曲线专家:酶联免疫吸附标准曲线拟合软件
克利图:实验数据绘图软件
统计:专业统计软件
GraphPad PRISM:著名的数据处理软件
中国非典型数据统计分析系统
交叉图表:多变量数据库图形显示软件
SigmaPlot: 30天全功能评估版绘图和数据分析软件包
SYSTAT:数据统计分析和制图的利器。30天全功能演示版
SigmaStat:智能统计软件30天全功能演示版
自动分离、拟合和分析非线性数据的软件
TableCurve:自动二维曲线拟合和经验公式搜索软件
SPSS:30天全功能演示版,非常权威和著名的数据统计处理软件
Origin:一个简单易用的工具软件,用于科学目的的数据绘制、数据分析和处理
自由软件,用于拟合生物曲线和分析数据
数据绘图助手:用于数据分析和绘制实验结果的专业软件
13、检索和阅读
专利:向美国国家专利商标局提交系列专利的辅助软件
Checker:向美国国家专利商标局提交系列专利的辅助软件
Ica32t.exe:中国生物文献数据库检索客户端软件
路径数据库检索器:(代谢途径数据库)检索器
公共爬虫:MEDLINE文献数据库和基因库核酸序列数据库检索软件
网络浏览器:PDG格式浏览器
Book Express:专门用于下载超级明星电子书的工具软件
尾注:专业参考咨询软件
参考经理:专业参考查询软件
Procite:参考文献检索管理软件
亮片:数据库GenBank,EMBL,DDBJ查询软件
迷你浏览器:数字地图浏览器
压缩:JBG(NLC)“JPG(NLC)”jpg转换功能软件
参考文献:参考管理软件
学者援助:一个整理日常数据如文献参考的软件
纸质作品:免费参考管理软件
知识仓库建设管理系统
14.基因芯片
AMADA:用于组织、研究、显示和分析微阵列数据的软件
扫描分析:微矩阵荧光图像分析软件
集群:用于分析和处理大量微矩阵数据集的软件
树形视图:用图形显示集群软件分析结果的软件
AMAD:微阵列数据库
ArrayMakerV:斯坦福大学布朗实验室提供的基因芯片研究成套设备的软件和文档
J-Express:用于分析微阵列实验获得的基因表达数据的软件
15.其他功能软件
数字化仪:图形数字化软件,可以将图形转换成数据和方程
绘图纸:绘图纸打印软件
DynaFit:用于处理酶动力学数据或配体-受体结合数据的软件
迁移:从遗传学角度估计人口迁移率的过程
阿列克:群体遗传学软件
正交设计助手:正交实验设计辅助工具软件
FBAT:家庭遗传关联测试的统计程序
GGT32:图形基因型表示软件
利用共显性标记数据推断亲缘关系的软件
Jarnac:代谢过程模拟软件包
Gepasi:化学生化反应动力学模拟优化软件
BCT:微生物趋势模拟计划
随机生化反应模拟软件
生物分子量:生物化学分子量计算软件
MatchCode:用于蛋白质和核酸序列的简单匹配和打印格式的中文软件
图谱管理器:分析回交、杂交和重组近交系遗传作图实验结果的软件
MolEco:一个用基因方法评估混杂交配频率的软件
画布:绘图软件
免疫室管理系统:中国免疫室综合软件
西里尔文:家谱绘图软件
冷冻细胞库监控器:用于管理生物样品(如细胞系、血清等)的程序。)储存在液氮容器中
小鼠:虚拟动物饲养设施,用于帮助管理饲养设施中的实验动物软件
代谢和酶受体结合模拟软件
Boxit:用于管理生物样本的数据库系统
GRR:检测家谱错误的应用软件
健康医学:药典软件
基因组数据库软件
MAPL98、DIAL98和gest 98:El编译的几种统计遗传学软件
PED:谱系绘图软件
谱系绘图软件
定量RT:内置宏程序的Excel文件,辅助定量RT-PCR实验
贝特维尤:用于管理和跟踪实验室小白鼠繁殖群体的Excel文件
MassXpert:一个帮助科学家预测和分析蛋白质组学研究中获得的蛋白质质谱数据的软件
用于分析、显示和模拟1D和2D磁共振图的软件
ACD/SpecViewer:免费光谱数据显示软件
自动呼叫分配器/核磁共振观察器:自动呼叫分配器/核磁共振用于显示自动呼叫分配器/核磁共振预测器
16、结构式
查看器:磁共振图谱文件的免费软件
用于分析流式细胞仪数据文件的免费软件
一个免费的工具,用于根据已知的成分值生成细胞周期的FCS文件
cycle chred:cellcyclean analysis软件
GX路径视觉:用于生成、编辑和显示生物代谢路径的工具软件
生物吴彼:生物医学专业的输入法
17.化学绘图
ACD/CHEMSKETCH:绘制分子结构的免费软件及其中文版
ACD/ChemSketch和ChemBasic:绘制分子结构的自由软件5.0版及其中文版
Chemfont:化学符号和图型字体,可以直接插入Word中的文章
Clip.:化学图片集,包含近400张与化学相关的GIF图片
ISIS DRAW:绘制化学结构式的免费软件
自主性:ISIS/draw软件插件
ChemWindows:绘制化学结构式的免费软件
MarvinSketch:用JAVA语言编写的小而易用的化学结构绘图程序
ACD/结构绘图小程序:一个免费的绘制化学结构式的JAVA小程序
化学笔:绘制化学结构式的软件
18.化学应用
Mmcalc.exe:分子量计算器
Hxfc.:化学方程式平衡软件
化学试剂制备计算器
命名有机化学的实践程序
chembl 32 . :Windows 95下的免费化学方程式平衡程序
元素周期表
元素高级周期表
计算机辅助配方软件
CFT:化学式老师
元素屋:查询112个元素各种信息的中文软件
化学反应方程式平衡器
化学实验室模型:化学实验教学软件及其中文版
元素自由周期表
化学品电子手册:化学品综合手册
19.在线综合工具
生物工作台:基于网络的生物学综合工具
下水道:收集互联网上常用的在线工具,本地版本
20.在线蛋白质工具
BCM搜索启动器:蛋白质序列二级结构预测的综合站点
DAS:蛋白质跨膜预测服务器,输入蛋白质序列,预测跨膜区
TopPred:蛋白质预测服务器提供的膜蛋白拓扑预测在线工具
SOSUI:膜蛋白分类和二级结构预测的在线工具
进行二级结构预测和跨膜拓扑预测
预测蛋白质序列的跨膜螺旋和拓扑结构服务器
SMART:提供蛋白质序列,在结构域数据库中查询/显示其结构域和跨膜区等。
TMpred:预测蛋白质序列的跨膜区
预测蛋白质的跨膜螺旋
蛋白质预测服务器:提供查询蛋白质数据库和预测蛋白质各种结构的服务
SPLIT:膜蛋白二级结构预测服务器
PRED-TMR:基于SwissProt数据库的统计分析,提供预测蛋白质跨膜片段的服务
一个基于互联网的预测蛋白质跨膜区的JAVA程序
TMAP:提供预测蛋白质跨膜片段的服务
21、RNA分析
模式搜索和发现:巴斯德研究所提供的一种常见的在线RNA分析工具
脱氧核糖核酸序列分析:巴斯德研究所提供的通用特征序列查询工具
搜索基因和编码区:巴斯德研究所提供的一种常见的在线DNA分析工具
寡核苷酸计算器:巴斯德研究所提供的搜索基因和编码区的工具
解链温度计算器:用JAVA语言编写的寡核苷酸计算器,给出核酸序列,计算GC百分比、解链温度、长度和分子量。可以下载用作小计算器
BCMgene-finder:核酸序列搜索服务器,提交核酸序列并选择相应的数据库进行序列搜索
22.在线初级设计
初级读本生成器:在线初级读本设计程序
Prime3:一个著名的在线引物设计程序
亮片:数据库GenBank,EMBL,DDBJ查询软件
迷你浏览器:数字地图浏览器
压缩:JBG(NLC)“JPG(NLC)”jpg转换功能软件
参考文献:参考管理软件
学者援助:一个整理日常数据如文献参考的软件
纸质作品:免费参考管理软件
知识仓库建设管理系统
结束
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