鱼儿拍动鳃盖一般是为了呼吸,因为鱼一般是用鳃来呼吸,水由口进入之后流经鳃由鳃盖后缘流出,当水流过鳃丝时,水中的溶解氧就会进入鳃丝的毛细血管中,二氧化碳就会由鳃丝排放到水中,两者进行气体交换,因此鱼用口吞水,用鳃孔排水,鱼的口和鳃盖不停地交合,就是鱼在呼吸。

大部分的鱼是用鳃来呼吸的,鱼的鳃包括鳃弓、鳃丝、鳃耙。鱼的鳃盖是鱼鳃外面的一些皮褶,有些鱼可以根据它的鳃盖来判断它的年龄。

鲨鱼和鳐类的鳃盖不发达,鳃裂直接在外界。还有无尾类的幼体,其鳃盖与硬骨鱼相似,都比较发达,但其后端大部分是与腹部皮肤相连接,只在左体侧残留有类似于鳃盖缝的小孔。

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