《软式内窥镜清洗消毒技术规范》(WS 507-2016)于2017年6月1日实施，规定了软式内窥镜清洗消毒相关的管理要求、布局与设施、设备要求、清洗消毒操作规程、监测与测量。一些消毒(灭菌)剂的使用方法列于附录B，包括邻苯二甲醛、戊二醛、过氧乙酸、二氧化氯和酸性氧化电位水。其中灭菌产品有戊二醛和过氧乙酸。戊二醛消毒剂杀菌时间长达10小时，大大降低了内窥镜的使用频率。戊二醛有刺鼻的气味，对眼睛、皮肤和粘膜有很强的刺激作用。醛类消毒剂的排放对环境有影响，京津冀地区限制了醛类消毒剂的排放。
除戊二醛消毒剂外，过氧乙酸消毒剂也是很好的消毒剂，杀菌时间≥10分钟，这种消毒剂的分解产物是水，对环境没有影响。过氧乙酸消毒剂是国家卫生计生委医院管理部门推荐的消毒剂。
许多医院在使用过氧乙酸消毒剂时出现絮凝沉淀。首先，絮状物是由于过氧乙酸去除生物膜的能力很强。管道中残留的生物膜在使用几次后会被去除。沉淀物现象是由过氧乙酸腐蚀手动清洗槽下的动力泵中的电磁阀(部分由铜制成)或其他金属合金材料造成的。过氧乙酸消毒剂腐蚀性强，对不锈钢基本无腐蚀，对碳钢轻度腐蚀，对铝中度腐蚀，对铜中度腐蚀。
对于内窥镜的手动清洗槽，第一次使用时，一定要询问清洗槽的制造商、动力泵管道的材料，如果有金属就更换零件，然后再使用。消毒的话，如果不用动力泵，可以直接用液体注射器填充内窥镜腔使用。对于单独的不锈钢罐，也可用于内窥镜的浸泡消毒或灭菌。
对于除污机，使用过氧乙酸消毒剂前一定要咨询厂家，消毒剂管道是否与过氧乙酸兼容，要找到能使用过氧乙酸的除污机。目前，过氧乙酸可用于明太克A+，杭州美美金田，广州顺元等除污机。
所以在使用过氧乙酸消毒剂之前，一定要提前询问相应的清洗槽和除污机的兼容性，以免造成不必要的麻烦。
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