北京大学出版社是一家综合型、学术型教育出版机构，坚持“立足北大，面向全国，走向世界”的发展战略，出版物已覆盖人文科学、社会科学、自然科学各领域，并正在向工程技术领域逐步拓展，致力于成为中国乃至世界出版业重要的高等教育教科书和学术著作、文化工程出版基地，努力出版一批被广泛使用的经典教科书和一批具有较强国际影响的学术研究著作，以及一批在文化传承和文化积累方面有标志性作用的文化出版工程，建设成为世界一流的出版社。
北京大学出版社编辑部门设有经济管理、法律、文史哲、典籍与文化等四个事业部，理科、社科、汉语、外语、综合、职教与工科等编辑室和教育出版中心、基础教育与教师教育中心；生产经营和管理服务部门设有市场营销中心、出版部、储运部、社办公室、总编室、财务部、人力资源部、版权管理部、投资合作部、信息中心、美编室、质检与终审室、校对科、读者服务部、北大书店等。此外，还设有中南办事处，全资子公司培文教育文化有限公司、北京大学出版社南通双基教育出版发行中心，控股企业北京燕大元照教育科技有限公司、北京博雅光华教育科技有限公司、上海圣大燕园文化传播有限公司、北京世纪智源教育科技公司、江苏京通博雅教育有限公司等。