1.泌尿学
皖南医学院义山医院泌尿外科成立于1957年。是省内早期泌尿外科专业。医生21人，其中主任医师、教授7人，副主任医师2人，硕士生导师7人，博士5人。病房共有床位74张，设有专科门诊、普通门诊和3个特殊疾病门诊(结石、肿瘤、前列腺)。
泌尿外科以微创治疗泌尿系统疾病为特色，微创手术比例超过90%，大力发展新技术，率先开发局部麻醉下PCNL、HoLEP、膀胱肿瘤内镜黏膜下剥离(ESD)、可视PCNL、腹腔镜下根治性全膀胱切除术+尿流改道等新技术。
目前，该学科已培养了50多名研究生和30多名博士。五年来承担并参与国家自然科学部、省科技厅、省卫计委、省教育厅、皖南医学院等近30个各级项目，发表SCI论文10余篇(单篇最高影响因子为8.568)，在核心期刊发表论文70余篇。
该学科注重对外合作，加强与国内外一流泌尿中心的联系。2018年，我院与海军军医大学长海医院合作建立“皖南医学院义山医院孙颖浩院士工作站”，在医疗、科研、人才培养等领域开展深入交流与合作，进一步提升我科综合实力，提升影响力。
2.心血管医学
心血管内科是医院的重点科室，成立于1972年，三个病房共有床位156张，其中冠心病监护床位18张。科室有36名医生，45名护士。硕士生导师8人，教授、主任医师12人，副教授、副主任医师7人，主治医师7人，博士5人，硕士生22人。安徽江淮名医2人，省卫计委领导1人。它每年为68000名住院患者服务，每年有100000次门诊和3500多次心脏介入治疗。
心血管医学是围绕三个中心构建的:胸痛中心、房颤中心、心力衰竭中心。其特点是心血管疾病的基础和临床研究，心血管疾病的规范化治疗，特别是心脏介入治疗。几乎所有的心脏介入项目都已开展，形成了人才梯队，分为冠状动脉介入组、心脏起搏电生理组和心脏术前治疗组。每年完成冠状动脉造影及介入治疗2500余例，射频消融术400余例，起搏器200余例，先天性心脏病介入治疗50余例。2017年1月被国家卫生计生委医院管理研究所授予国家冠状动脉介入培训中心。
该系获得国家自然青年基金1项、安徽省自然科学基金5项、安徽省教委基金10项、安徽省卫生厅基金12项资助，获得安徽省自然科学三等奖3项、安徽省科技进步三等奖3项、卫生部科技进步奖1项、市级科技进步奖1项。发表论文500余篇，发表国家重点和全国性杂志400余种，其中SCI收录论文16篇；他出版了12本不同种类的书。每年接待几个县市的进修生20多名；培养10多名研究生。五年来，每年成功举办一两个国家级继续教育班，每班近300人。
3.麻醉学科
皖南医学院义山医院麻醉科成立于20世纪50年代。经过几代老年人的共同努力，该系已成为一个医、教、研协调发展的综合性系。目前教授3人，副教授3人，硕士生导师5人，博士2人，博士3人，硕士生24人，硕士生3人。层流手术室32间，PACU室10间，年麻醉手术量3万余例，在手术室承担各种麻醉，如:心内直视手术、冠状动脉搭桥术、心脏血管置换、复杂颅内肿瘤及血管显微手术、婴幼儿手术等。；日间手术麻醉；手术室外各种检查治疗的麻醉；分娩镇痛，同时进行疼痛门诊。该系隶属于临床麻醉教研室，已被批准为省级专业综合改革试点(2012年)和国家级专业综合改革试点(2013年)。麻醉科是皖南医学院麻醉学硕士学位授予地，每年招收研究生20余人，目前硕士研究生40余人。麻醉科是国家住院医师培训基地，中华医学会麻醉学分会超声技术培训基地。
近年来获得省卫生厅、省教委科研经费20余项，在SCI、重点核心期刊、国家级期刊发表论文100余篇，参与撰写专著10余部。2008年、2010年获安徽省科技进步三等奖，2012年获芜湖市科技进步三等奖。
4.胃肠外科
2010年，为响应普外科的专业化建设，成立了皖南医学院附属一级甲山医院消化内科，床位49张，为皖南医学院硕士单位，一级甲山医院重点专科。
系内教授3人，主任医师3人，副主任医师10人，主治医师1人，住院医师2人。他有一个博士学位和十个硕士学位。师后注重专业化发展，在各种胃肠肿瘤的标准化、个体化治疗和微创手术方面达到领先水平，在胃肠肿瘤腹腔镜手术方面不断努力，形成了胃肠手术微创治疗的特色。率先开展胃肠癌MDT(多学科协作)讨论，并举办多阶段微创治疗继续教育活动，充分展示我院在全省胃肠癌治疗中的领先地位，也确立了我院作为皖南医疗中心在胃肠疾病治疗中的地位。每年完成各种胃肠肿瘤标准化根治手术500余例，其中60%为腹腔镜手术。
近年来，在安徽省科技厅、教育部、卫生部、医学中心承担了10余项合作临床项目，发表著作30余部。承担本科生和研究生的教学和科研任务。2013年获皖南医学院优秀教学部。
5.临床实验室
皖南医学院附属义山医院医学检验科成立于1951年初。经过几代人的共同努力，现已发展成为专业门类齐全、重点专科突出、特色鲜明、多学科发展的综合性临床诊断科室。2010年我科获得第一批国家住院医师规范化培训基地，2012年获得临床检验诊断学硕士学位。目前是皖南、皖江最大的集医疗、教学、科研为一体的现代医学检验中心。
系内人员51人，其中高职称2人，副高职称8人，副教授5人，硕士生导师8人。博士4人，硕士14人。工作人员学术水平高，年龄分布合理，职称比例协调，专业设置齐全，仪器设备先进。该系主要研究细胞和分子遗传学、临床分子生物学和临床微生物学。其中，遗传学实验室已成为皖南、皖江地区最大、检测项目齐全的医学遗传学筛查诊断中心。
近年来，医学检验系获国家自然科学基金3项，省级自然科学基金4项，教育部、皖南医学院等各级项目20余项。“十二五”期间参与编写2部国家规划教材等10部著作，在国内外期刊发表学术论文60余篇，SCI收录论文10余篇。
6.肝胆外科(一、二病房)
2010年，原普外科进行重组，建设专科，成立肝胆外科。现为皖南医学院逸山医院临床医学重点专科。科室分两个病房，开放床位72张，专家门诊和知名专家门诊。医生23人，其中主任医师、教授3人，副主任医师7人。博士5人，硕士16人。拥有安徽省“江淮名医”、“省卫计委青年带头人”、“安徽省百优博士”等多项荣誉称号；而且省内各种学术组织的很多人都担任过几家杂志的副主任和编辑。
该科主要从事肝、胆、胰、脾等各种疾病的诊断、治疗和基础研究。近年来主要致力于微创技术的临床应用，其中腹腔镜技术已形成区域优势，率先在安徽省开展腹腔镜肝切除、腹腔镜胰十二指肠切除术等困难手术；率先在皖南开展肝肿瘤射频消融治疗，形成肝肿瘤综合治疗模式。此外，多镜结合电液碎石术治疗肝内外胆管结石也形成了自己的特点。
近年来，该系承担了国家自然科学基金、科技部、省科技厅、教育厅、吴阶平医学基金等近20个项目，开展了10余项三新项目，发表学术论文100余篇，其中10余篇被纳入SCI。曾获安徽省医学科技进步奖三等奖、芜湖市科技进步奖二等奖、皖南医学院一线山医院多项科技奖励。培养40多名研究生。
7.血管手术
皖南医学院义山医院血管外科是一门新兴学科。1999年，在医院领导和历届普外科主任的支持下，在普外科成立了血管外科团队。2006年7月，独立血管外科正式成立。经过不断发展，现有固定床位30张，医护人员18人，其中主任医师1人，副主任医师2人，医生1人，均具有硕士以上学历。
自1999年成立以来，血管外科已经能够例行进行困难的手术，例如腹主动脉瘤切除和人工血管移植、颈动脉体瘤切除、下肢动脉硬化闭塞症和下肢血栓闭塞性脉管炎的旁路手术。近10年来，独立开展了胸主动脉瘤腔内隔绝术、胸腹主动脉夹层动脉瘤腔内支架植入术、下肢动脉硬化闭塞症支架植入术等血管内微创治疗。
血管外科本着务实创新的宗旨，十分重视血管外科领域的临床研究，对血管外科疑难疾病的治疗进行深入研究。近两年来，我系承担了5个省级和省级项目，发表论文40多篇。2007年参加普外科，获省重点支持学科。作为独立科室，被评为医院重点学科。
8.乳房手术
皖南医学院一线山医院乳腺外科是以外科治疗为主，开展各种辅助治疗的专科。医务人员30余人，其中博士16人，高级职称8人，中级职称2人。博士1人，硕士11人。总共有45张床。本科立足于一级山百年老院文化，拥有经过专门培训的专业技术人员和一流护理人员，并辅以国内先进的技术设备(全数字化钼靶机及定位系统、乳腺内窥镜、乳腺腔系统、甲状腺腔系统、新型微创乳腺活检装置、true 空辅助微创乳腺旋转系统等。)，强调以专科为基础的多学科联合合作模式。为患者提供最佳的诊疗方案，保乳手术、一期乳房重建、前哨淋巴结活检、乳腺疾病微创内镜手术、甲状腺癌功能性颈淋巴结清扫、术中监测喉上神经和喉返神经、内镜甲状腺美容手术等。尤其是口腔内镜技术的发展为微创手术带来了新的途径。目前，我科每年约有30例内窥镜手术。乳腺癌根治术后背阔肌联合假体乳房一期重建越来越成熟，受到很多年轻患者的欢迎。
同时，该系承担皖南医学院的本科教学任务、临床教学和基础科研工作，每年培养4-6名研究生，接受其他医院的博士继续深造。完成多项省部级科研项目，每年在省级以上期刊发表多篇专业学术论文。第一乳腺外科全体医务人员坚持与时俱进，坚持“以人为本，患者至上”的服务宗旨，以优质的服务和精湛的技术造福患者。
9.核医疗学
皖南医学院义山医院核医学科是安徽省最早的独立核医学学科。2002年被批准为第二轮临床医学省级重点支撑学科，2016年被批准为临床医学省级重点专业。科室由PET/CT中心、SPECT室、器官功能测定室、放射性核素治疗病房、体外免疫测定室组成。
核医学科医疗技术护理人员17人，其中主任医师1人，副主任医师4人。博士2人，硕士9人。
目前，该科拥有西门子biogeraph mcts (64) pet/CT仪、GE Infinia VC Hawkeye 4经济型符合电路/SPECT/CT仪、甲状腺功能测试仪、多种化学发光免疫分析仪、全自动γ免疫计数器等大型设备，并已率先在全省设立核医学门诊和病房，学科规模和硬件设施领先。体外标记免疫分析、放射性核素显像(内分泌、心血管、神经、骨骼、泌尿和呼吸系统的SPECT显像和肿瘤的PET/CT显像)、放射性核素功能测定和放射性核素治疗(甲状腺疾病、肿瘤骨转移和碘-125粒子植入治疗等。)全面展开，技术项目齐全。
近年来，陆续开展了20多项新技术、新项目，形成了体现专业优势的特色项目，如化疗中期18F-FDG PCT/CT对弥漫性大B细胞淋巴瘤的疗效评价和预后、碘-125粒子植入治疗、小肺结节VATS术前定位、PET-CT引导下针吸活检靶点选择、HE4联合CA125试验(ROMA值)评估卵巢癌风险等。，发表了30篇论文。
10.干预科
宜山医院介入科介入诊疗始于1990年，是安徽省最早开展介入诊疗的单位之一。现在有25张开放床，每年治疗1000多名患者，每年进行1000多项介入手术。科室医师6人，其中主任医师1人，副教授1人，副主任医师2人，研究生4人，硕士生导师1人。介入诊疗设备包括4台大型数字减影血管造影机(DSA)、1台微波消融治疗仪和1台放射性粒子治疗计划系统(TPS)。
介入科作为皖南介入诊疗的临床、教学、科研中心，对实体恶性肿瘤的综合治疗进行系统研究，采用血管介入与非血管介入相结合的方法，配合靶向治疗、基因治疗、免疫治疗等方式，提高患者的中长期疗效；与此同时，一些血管疾病、良性肿瘤、良性病变和临床急性大出血的介入治疗也在不断完善。在保证提高疗效的同时，如何减少副作用，保护器官组织功能也是积极探讨的；晚期癌症疼痛的介入镇痛也正在积极研究中。
近年来在皖南医学院承担本科教学、研究生培养、学科培训、实习教学等工作。承担过2项省级科研项目和4项皖南医学院科研项目，在国家级学术期刊发表论文30余篇，参与撰写著作5部，其中SCI论文5篇。
11.传染病科
皖南医学院义山医院传染病科是皖南最大的传染病治疗专业，集医疗、教学、科研、预防、保健于一体。该科拥有一支充满活力的专业队伍，以中青年为主，其中主任医师2名，副主任医师6名，主治医师10名，住院医师5名。博士1人，硕士12人；有2个硕士导师。主持过2项国家自然科学基金、1项安徽省自然科学基金、2项省级教育厅项目、3项卫生部项目、3项渭南医学院中青年项目、1项宜山医院博士研究启动基金；获中国预防医学科技成果二等奖。近三年在国内外核心期刊发表论文20余篇，其中SCI收录论文2篇；参与出版专著2部；多次在省内外学术会议上发表学术演讲。传染病科自成立以来，受到卫生部和省卫生厅的好评。2007年被省卫生厅评为“省级临床专业”。
传染病科高度重视疑难危重病人的诊治，开发了多种诊疗新技术。近年来，他成功主持治疗了2006年底国内首次报道的一批人无浆体病患者。此后，许多患有新传染病的患者，如H5N1感染、新布尼亚病毒感染和恶性疟疾，都得到了成功治疗。开发一些新的诊断和治疗技术，如支气管动脉栓塞治疗肺结核大咯血，经皮肝食管胃底静脉栓塞治疗肝硬化上消化道大出血，栓塞治疗脾功能亢进。
12.烧伤整形外科
本课题是皖南、皖江唯一的集医疗、教学、科研为一体的正规烧伤整形治疗中心。其规模、人员、设备、医药、教学和科研均处于省内领先水平，主要负责临床烧伤整形外科的诊疗工作。同时在皖南医学院临床学院负责基础外科、烧伤、冻伤的教学工作。
科室常规床位38张，均为全净化空空气消毒病房，设有4个单人重症监护室和其他功能治疗单元，如沉浸式浴室、更衣室、清创室等。配有家用浸泡消毒浴缸、翻身床、有创无创监护仪、输液微泵、红外光谱治疗仪、电动剥皮刀、剥皮机等先进设备。
本科开展急慢性创面修复工作多年，其中“一步复合皮移植技术”达到国内先进水平，并被全国各大医院邀请进行手术示范和教学。在大面积烧伤的治疗、烧伤感染的预防和治疗、复杂烧伤和复杂创伤的修复、疤痕和先天性畸形的整形手术、恶性体表肿瘤的治疗等方面处于全省领先地位。并荣获国家“中国糖尿病相关慢性伤口治疗教育项目培训基地”。
烧伤、急慢性创面修复、皮肤肿瘤等临床和基础研究开展较早，国内外学术期刊发表论文30余篇。五年来，获省市科研项目4项，发表著作10余部，其中4部被SCI收录。其中，皮肤鳞状细胞癌和恶性黑色素瘤的免疫治疗研究已达到国内领先水平。
13.性医学系
性医学系前身为皖南医学院计划生育实验室，成立于1981年。80年代主要从事计划生育和生殖内分泌的研究。90年代主要从事计划生育、性发育异常、生殖内分泌紊乱、性功能障碍、不孕症的研究和临床治疗。1997年被省卫生厅评为“临床医学专业”。2007年11月，被安徽省卫生厅授予临床医学重点发展学科。普通门诊3家，专家门诊1家，知名专家门诊1家。包括上环国际培训中心、实验室、男科工作站、手术室。
该科现有医务人员包括一名主任医师和一名副主任医师。博士1人，硕士5人。
目前诊治主要涉及性功能障碍、性发育异常、不孕不育。进行常规男性检查，如核不扩散条约-霍尔特，AVSS，ICI，CDDU，阴茎海绵体造影术和阴茎敏感度。精子形态学检查、生殖免疫检查、输精管造影、输精管附睾吻合术、睾丸附睾微创取精术等。前列腺炎和前列腺增生的药物治疗、热疗和微创治疗。开展前列腺疾病微创手术、精细曲度手术和阴茎阴囊疾病手术。
近年来，该系获得安徽省、芜湖市科技进步奖三等奖，并获得国家自然科学基金、安徽省自然科学基金等科研项目20余项。他在《亚洲男科杂志》、《泌尿学杂志》、《性医学杂志》、《男科和生长因子》发表了100多篇科研论文。
14.胸心外科2
皖南医学院一线山医院胸心外科二病房成立于2011年9月。目前在职医师9人，其中主任医师1人(在加拿大某著名心脏外科医院工作一年)，副主任医师2人，主治医师3人，住院医师3人，医师1人，硕士8人(3名医师在读)。科室工作人员已经去国内外各大心脏中心进修。
我科以胸心血管疾病的基础和临床研究及规范化治疗为特色。电视胸腔镜心脏手术自2011年科室成立以来，一直独立开展，创伤小，恢复快。目前在省内处于领先地位，在国内处于先进水平。重度瓣膜手术是我科的特色之一，包括高龄患者、重度心功能不全患者及各种并发症的外科治疗。同时，注重改善患者的长期预后和生活质量。生物瓣膜的利用率和瓣膜成形术的比例在我省常年领先。近年来，急性主动脉综合征的规范化“一站式”治疗广泛开展，包括A型夹层急诊手术、B型夹层腔内隔离治疗和溃疡血肿，成功率较高。是省内少数几个独立掌握这项技术的科室之一，提高了医院相关团队的整体水平和医院的影响力。
该科技术全面，在成人先天性心脏病、重症冠心病、心律失常的外科治疗方面有较高造诣。整体手术死亡率低，并发症少，在本地区及周边地区赢得了良好的社会效益。在普通胸外科手术中，常规在胸腔镜下对各种食管、肺和纵隔肿瘤进行手术治疗，以全面提高患者的长期生存率。
15.耳鼻喉科
皖南医学院逸山医院耳鼻咽喉头颈外科于1977年作为独立科室成立，是医院重点培养专业。现在是硕士项目，全国住院医师规范化培训基地，新农合重大疾病人工耳蜗定点医院。目前，综合科医务人员19人，其中高级技术职称8人，博士3人，硕士7人，硕士2人。目前有标准床位54张，设有临床听力中心、睡眠呼吸障碍诊疗中心、内镜室，日均门诊量200人次以上，每年治疗患者3000余人。曾在皖南医学院负责耳鼻喉科、头颈外科的教学和临床实践，也负责研究生、住院医师和进修医师的教学和培训。
科室配备了手术显微镜、CO2激光治疗系统、鼻内窥镜、多导睡眠图、血浆、完整听力检查设备等多种进口高端医疗设备。，其技术水平在安徽省处于领先地位。可独立进行常规耳鼻咽喉头颈外科手术和一些难度较大的手术，如人工耳蜗植入、耳内窥镜手术、鼓室成形术、鼻内窥镜手术、喉切除和头颈肿瘤切除及功能重建等，在耳鸣、头晕、阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征(打鼾)的综合治疗方面有自己的特色。
近年来承担了国家自然科学基金、省级科研等多项科研项目，参与了多项国家和省级重点项目。近年来，国内外杂志发表论文100余篇，其中SCI论文5篇。
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