北京疾控中心的杨鹏表示，北京新发地的病毒溯源仍在进一步调查中。“通过全基因组测序，发现病毒来自欧洲，初步确定与输入有关。但是病毒是怎么来的还不确定。可能是被污染的海鲜或肉类，也可能是进入市场的人通过分泌物传播。”
中国疾病预防控制中心首席流行病学家吴尊友表示，根据以往的知识和经验，北京本地突然出现COVID-19疫情有两种可能。
第一种可能是批发市场被SARS-CoV-2污染的海鲜或肉类是源头。批发市场的很多海鲜、牛羊肉都是外地进口，包括海外进口。目前，全球每天新增10万多例COVID-19，感染SARS-CoV-2者在处理海产品或牛羊肉时可能造成污染。而且在批发市场，很多海鲜、牛羊肉都是冷冻保存的。在这样的环境下，病毒可以存活很长时间。
这些产品送到北京的批发市场后，批发市场的人在操作时会接触到被污染的产品，然后揉鼻子揉眼睛，就会被感染。症状一开始比较轻微，如果没有意识到，可能会在工作中造成人传人。
第二，还有其他传染源。新发地批发市场人流量很大，市场的人来自四面八方，进出新发地批发市场的人是传染源。例如，他可能是来自其他焦点的人。被感染后症状很轻微，当时也没注意。从此对新发地批发市场造成污染，导致疫情集中。由于目前发现的几起案件与新发地批发市场有关，注意力已经转向新发地。
至于市场上被污染的海鲜或肉类是否是最初的传染源，或者进出市场的人是否是传染源，这两种可能性都存在。但从北京目前的情况来看，第一种情况可能性更大。
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