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总的来说，中国农业资源、农业用地面积和水资源短缺。近年来，随着我国大规模的城市化运动，大量耕地被转化为工业和居住用地，耕地面积从2001年的19.14亿亩迅速减少到2011年的18.23亿亩，减少了4.7%(见图7)。中国人均耕地面积只有1.35亩(2011年)，是世界平均水平(3.3亩/人)的41%，是OECD平均水平(5.25亩/人)的26%。此外，中国农业生产耗水量巨大，占全国总用水量的60%以上，但中国人均水资源只有世界平均水平的1/4。此外，我国农业生产用水效率低，吨粮单位用水量高达1300立方米，比发达国家(吨粮单位用水量1000立方米)高出30%。

同时，在城市化运动下，大量农村人口进入城市，工业生产吸收了大量农业劳动力，间接导致农业劳动力资源减少。农村人口从1992年的历史峰值8.44亿下降到2012年的6.95亿。相信随着经济发展和城市化进程的推进，农村劳动力资源将进一步紧张。除了土地和人口等生产资源日益受到限制外，近年来极端天气、自然灾害和牲畜疫情造成的农业生产风险和波动也逐渐增加。全球变暖、气候变化加剧、不稳定因素增多，导致极端气候灾害频繁发生，危害强度加大，给中国农业带来了挑战。在全国极端降水、暴雨洪水频发、华北西南干旱日益加剧的严峻形势下，我国农田基础设施普遍不发达，灌溉、排水等水利设施不完善。农业设施难以抵御恶劣天气等自然灾害，突出了农业的弱质性。此外，近年来，中国畜牧业尤其受到疫情的影响，尤其是家禽养殖业，多次受到禽流感疫情的影响，产量和出口量受到严重影响。2013年3月H7N9疫情导致中国家禽业损失400亿元。然而，由于禽流感防控的季节性、重复性和复杂性，目前学术界和工业界都没有有效的预防方法，这也增加了我国未来家禽养殖业发展的风险。

我国种植业规模低、劳动生产率低，主要是由于人均耕地面积狭小、分散造成的。对2010年17个大国农业经济的比较研究表明，中国农业劳动生产率在17个大国中是最低的，人均农业增加值仅为545美元，与高收入国家(38347美元)相差70倍，与中高收入国家(3607美元)相差6倍，甚至低于中低收入国家(622美元)。此外，中国人均耕地规模远低于发达国家，甚至低于与中国人口密度相当的印度。但值得一提的是，我国单位耕地面积产量居世界第一。2010年，中国每公顷耕地粮食产量为5521公斤，而其他中等收入国家的产量在2000至5000公斤之间，平均只有3600公斤。这说明现有农业土地资源和规模的限制，大大降低了我国农产品的人均产值水平。