鹿的大体解剖形态与牛、羊等其他反刍动物相似。
鹿头的特点是额头宽，脸窄。颈部一般细长，有7块颈椎骨。胸部更宽。胸椎13块，左右各一根肋骨，也就是13对肋骨。胸骨两侧有7对肋窝与真肋相连。剑状软骨发育良好。有6块椎体稍长的腰椎。有五块愈合的椎骨形成骶骨；7-9节尾椎骨。前肢骨从上到下依次为肩胛骨、肱骨、尺骨和桡骨、腕骨、掌骨和指骨。后肢的骨头从上面看就是骨盆。从髋关节连接股骨、胫骨和腓骨、髌骨、跗骨、跖骨和趾骨。鹿肌肉发达，尤其是胸部和上肢。鹿肌是红色肌肉，肌肉细胞富含肌红蛋白。四肢下肌腱粗而长。
鹿有一个鼻镜，里面有鼻和唇腺，可以分泌汗液。鼻孔小，鼻翼活动差。气管较长，有49-55个软骨环。左右肺各有三个肺叶和另一个中叶。心脏在肺之间的左边。呈圆锥形。鹿有四个胃:瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃。瘤胃体积最大，几乎占据了左腹部的大部分。肠道分为十二指肠、空肠、回肠、盲肠、结肠和直肠，在到达筒门之前与皱胃相连。十二指肠附近有胰腺组织。鹿肝就在横膈膜后面中间，分为左、中、右、尾四个肝叶。没有胆囊。脾脏近似椭圆形，表面蓝绿色，切面红棕色。在腹部左侧。一肾左右，如蚕豆形，红褐色。表面光滑无沟槽，结构截面多乳头。
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