有氧呼吸的第一阶段是在细胞质的基质中进行。即在无氧条件下把一个分子的葡萄糖分解成两个分子的丙酮酸，同时脱下4个活化氢，在葡萄糖分解的过程中释放出少量的能量，其中一部分能量用于合成ATP，并产生少量的ATP和NADH。
有氧呼吸是指细胞或微生物在氧的参与下，通过多种酶的催化作用，把有机物彻底氧化分解，产生二氧化碳和水，释放能量，合成大量ATP的过程。有氧呼吸是高等动植物进行呼吸作用的主要形式，通常说的呼吸作用就是指有氧呼吸。
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