基因结构 分分钟教你绘制基因结构图！

最近全国都大大降温了，所以这种天气最适合坐在电脑前整理资料，看文献，做图表。边肖今天介绍了一种用于基因结构在线绘图的工具，基因结构显示服务器，它简单而强大。利用它，我们可以画出清晰的基因结构，并清楚地显示外显子、内含子和UTR的位置。也可以结合其他数据绘制进化树-基因结构图，展示基因结构与系统进化的关系。

打开该工具，其界面如下:

1.数据输入类型

图形输入文件中有四种类型的数据:

你可以在基因组GFF文件中筛选这些基因信息。第一列是基因ID，第二列是起始位置，第三列是终止位置，第四列是该位置的基因是外显子还是UTR，第四列是注释信息，第四列不需要。

GenBank登记号或GI:可从GenBank获得。需要注意的是，你输入的接入号码或gi必须包含mRNA序列

GTF/GFF3:基因注释文件，可以下载数据库中的基因组GFF文件，筛选出你的基因注释信息

序列:基因的CDS序列存储在第一个盒子里，基因的完整序列存储在第二个盒子里，可以从NCBI数据库下载，也可以在基因组数据中搜索需要ID的序列

边肖在这里推荐床格式数据。数据格式简单。您可以在基因组GFF文件中过滤这些基因信息。你可以从我们之前的文章下载基因组GFF文件

2.图纸和图片的修改和保存

选择一种数据类型，单击示例，将显示这种数据类型的示例。您可以直接将自己的数据复制粘贴到下面的框中，或者直接选择存储数据的文件来导入数据。

数据输入后点击右下角的提交，会跳转到结果页面。如果要保存此图片，右下角有三种图片保存方式。选择要保存的图像格式，例如，如果要以PNG格式保存图像，点击PNG，会弹出一个图片界面。

下图为弹出的图片页面，右键网页另存为就会弹出一个框，输入图片名字点击保存就可以了。 下图是弹出的图片页面。右键单击网页并将其保存为弹出框。输入图片名称，然后单击保存。

如果你认为网站的颜色不好看，你可以改变这些网站的颜色。比如你想改变代表CDS形状的颜色，点击左下角颜色后面的黄色框，会弹出一个颜色选择界面。在纯色界面中选择颜色。点击确定，返回结果界面。然后点击图片左下角的重绘，所有代表CDS的形状都会变成你选择的颜色。

下图是修改颜色后的图片:

3.添加其他信息图纸

基本功能完成，好的功能强大！不要慌，这里有两个扩展功能。第一种是将进化树和基因结构结合起来，第二种是在进化树和基因结构之外加入基因的其他结构信息如基序或结构域。

首先我们把进化树和基因结构结合起来，先导入基因结构数据文件，点击下图绿色的数据框，会扩展出一个输入数据的界面。输入构建进化树时生成的nwk文件，点击提交生成图片，图片保存修改参照上述方法。

如果要显示图片中基因的其他信息，如基序或结构域，点击其他特征，输入数据。第一栏是ID，第二、三栏是这个基因座的起点和终点，第三栏是这个基因座的名称，如基序1或结构域。单击提交进行绘制。

你完了。又是一张好看又实用的图。

有什么建议欢迎来评论区留言讨论！

附加工具地址:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php,你可以通过点击它来使用它，这样你就不用再担心画画了！

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