福建工程学院图书馆现由鳝溪校区图书馆、仓山校区图书馆、浦东校区图书馆和旗山校区图书馆四部分组成，现有总面积约4.58万平方米。其中旗山校区图书馆面积超30000平方米，总投资1.6亿元，高72米，是福州大学城最高的建筑物，也是福建工程学院的标志性建筑。福建工程学院图书馆现有馆藏纸质图书168.56万册，电子图书192.38万册，纸质期刊1100余种，基本形成了以建筑、机械、电子为特色，以计算机科学、自动控制、材料等高新技术学科为重点并兼顾基础学科的工、理、管、文相结合的多学科藏书体系。