GO和KEGG分类富集图绘制工具结合标注信息为给定的基因集绘制GO分类富集图、KEGG分类富集图和途径富集图。GO分类富集图是通过对基因GO项富集程度的统计分析,计算基因的P值和校正P值,定位最可能与基因相关的GO term。KEGG分类富集图是一种生物调控途径,可以丰富显著途径,有助于发现实验条件下的显著变化。
操作步骤
登录百迈云柯主页(www . biocloud . net)-分析-工具-绘制GO和KEGG富集图。
操作方法
1.输入文件
案例展示
很多老师都认可了白玛克云平台的GO和KEGG分类和丰富地图绘制工具。目前已经有老师用这个小工具发表文章了。如郑州大学安课题组在四倍体和二倍体芜菁转录组的比较分析中使用了GO和KEGG分类富集图绘制工具,文章发表在《植物科学前沿》上。
此外,中国农业科学院油料作物研究所胡琼老师课题组在油菜分蘖调控涉及的信号通路研究中也使用了GO和KEGG分类富集图绘制工具,文章发表在Int J Mol Sci上。
白马客云平台是北京白马客生物科技有限公司开发的生物大数据分析平台,集生物信息分析软件、数据库和云计算于一体。GO、KEGG分类丰富图绘制小工具介绍在此,请关注白玛客云微信的微信官方账号,后期会有更多小工具介绍和操作指导,如果在操作过程中遇到问题,可以联系我们的云客服,欢迎点击屏幕右下方的客服图片进入咨询环节。
参考文献:
1.用宏基因组学方法解析中国不同城市垃圾渗滤液中的抗生素耐药性。[J]。水研究,2018,134:126–139。
2.整合的核糖核酸和微小核糖核酸图谱分析揭示了溴化氢和生长素信号在植物分枝角度调控中的可能作用。甘蓝型油菜:[J]。《国际分子科学杂志》,2017,18(5):887。
1.《百迈客云平台 百迈客云平台——助您轻松搞定GO、 KEGG富集图绘制》援引自互联网,旨在传递更多网络信息知识,仅代表作者本人观点,与本网站无关,侵删请联系页脚下方联系方式。
2.《百迈客云平台 百迈客云平台——助您轻松搞定GO、 KEGG富集图绘制》仅供读者参考,本网站未对该内容进行证实,对其原创性、真实性、完整性、及时性不作任何保证。
3.文章转载时请保留本站内容来源地址,https://www.lu-xu.com/guoji/686792.html