指纹考勤机的核心部分是指纹识别系统，通过专用光电转换设备和计算机图像处理技术，对活体指纹进行采集、分析和比对，能够快速、准确地识别个人身份。该系统一般包括指纹图像采集、指纹图像处理、特征提取、特征值比较和匹配等。因此，在手指皮肤完好，角度方向正确的情况下，指纹考勤机可以靠近并轻轻按压手指，完成上班考勤。
指纹考勤机厂商工程师表示，指纹考勤具有快速、准确、方便识别的特点，使得考勤智能化。指纹膜是指纹考勤机的关键部分，也是最脆弱的部分。指纹膜使用时间越长，指纹识别率就会越低。没有任何人为的划伤和损伤，一年后越来越多的指纹无法识别或者需要反复识别。解决办法是更换指纹膜，几百块钱，不算服务费，是单独的材料费，一般一年左右换一次。
指纹考勤机的主要优点是不需要携带卡，指纹考勤基本上可以保证代打卡的现象不丢失卡。缺点是指纹考勤机在几百人以上使用时，处理时间比其他打卡方式慢几倍。同时，当静电干扰、汗盐、其他赃物、手指磨损、接近角度或压力不同时，采集头很难读取指纹，轻的识别效率低，重的识别失败。
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