不管是在论坛上还是网上,经常有人问哪里可以下载到破解版的FlowJo或者破解版的× ×。也许商业软件的宣传深入人心。但是我很想说,有一个自由流分析软件flow,五年前生产的。虽然五年多没有更新,但功能绝不逊色于大多数商业流量软件。
这个软件是芬兰的Perttu Terho等人开发的,用流程图分析,功能齐全,思路清晰。因为分析流程和FlowJo略有不同,所以必须注意以下步骤。
像其他软件一样,更改坐标参数是通过在坐标上单击鼠标右键来选择的。要设置门,请在图中的空白色区域单击鼠标右键,然后选择创建新区域。至于门的名称、颜色、逻辑组合和删除,在右边的人口窗口中使用鼠标右键。我觉得这些功能都比Flowjo好,尤其是逻辑组合:
选中此框,选择FCS文件,然后右键单击选择减少事件的方法,可以是固定数字、百分比、文件头或交错事件。最后,将此事件数缩减器与散点图连接,可以显示缩减数的图形:
3.特点:让直方图门自动微调
不同的数据文件之间,如果两个峰值比较明显,但是它们的分组位置略有变化,人们往往需要手动调整,少数文件就好说了。如果几百个数据一个个调整,那就累死人了。
流动具有自动微调功能。不知道是不是无知。我觉得这个功能很有特色。很少有软件有这个功能。
首先画一个直方图,然后在上面画正负峰区域。这一步必须完成:
然后,从菜单创建→区域控制工具中选择将区域移至负和正总体上:
用鼠标右键单击该框,然后选择活动控件:
至于自动调整的算法,有三种算法可以选择,大部分都是用第一种。如果峰的分离不是特别好或者第一个被打破,可以选择后两个:
然后使用菜单中目录下的下一个文件或快捷键ctrl+n切换到下一个文件:
见下图效果:
4.补偿调整
虽然flow的补偿调整没有商业软件直观拖动滑块那么简单,但是相对清晰容易。
选择创建→数据修改工具下的补偿数据功能:
出现一个空白色方框,将方框与所选FCS文件的散点图连接(注意箭头方向),然后依次按照下图中的数字标识:编辑修改→在窗口中选择调整补偿的参数,从第二个参数中删除第一个参数→点击保存,调整溢出值,即可看到散点图上的图形补偿发生了变化:
5.直方图叠加
在创建→可视化工具下选择叠加直方图:
然后用这个方框连接其他直方图(箭头指向这个方框),可以完成叠加,但是坐标要求同名:
这里是FLOWER问一下,我想给直方图加颜色,比较好处理。只需给两个普通直方图添加颜色,叠加的直方图就会自动显示透明颜色:
6.批处理和统计
商业软件的批量处理已经做了,flow的批量处理一点也不逊色。
比如我想统计一个抗原的表达率。经过一步一步的设置门,我终于选择了抗原表达的直方图或者散点图。在鼠标右键菜单中选择“创建统计”,将出现“统计”框,显示所有常用参数。这只是第一步。接下来,在统计框上单击鼠标右键,并选择创建统计列表。接下来,只需在散点图或直方图上按CTRL+N或CTRL+P来切换前后的数据,就会看到StatList上的数据是不断添加的。最后,您只需要复制StatList上的数据。
更多视频介绍
这次我们简单介绍一下这六个功能。软件中有很多功能强大的功能,足够大家使用。作者发布的简单视频中,介绍比较多,可以稍微看一下(视频比较糊,不过看懂就行):
如果需要更详细更高清的视频教程,可以在官网下载wmv格式的视频教程:http://flowingsoftware.btk.fi/index.php? Page = 4,但是网速可能会比较慢。
装置
这个软件需要的支持。net framework 3.5,需要从微软网站下载:http://www.microsoft.com/zh-cn/download/details.aspx? ID = 21 flow官网下载程序是clickonce发布的,所以安装时默认会安装到c:temp,容易被误删。所以我会把这个目录下的程序解压重命名,打包上传到这里。安装后。net framework 3.5完成后,您可以直接解压缩并运行它们:http://www.flowcyto.cn/bbs/forum.php? mod = view thread & amp;tid = 1664 & amppage=8#pid11275
现在如果非要找商业软件,我会很无奈
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