时隔六年，徐克亲自上阵执导《黑侠2》。由于李连杰当时已经是国际巨星，忙于在好莱坞拍摄，没有时间出演这部电影，所以投资人决定用在美国长大的新签约武术演员安志杰来挑起电影大梁，接替李连杰成为新一代“黑侠”。

因为《黑侠》角色的变化，《黑侠2》的故事也发生了变化，与之前的故事无关:讲述了一个神秘组织“暗影集团”通过基因改造技术制造了一批强化人类佣兵，安志杰饰演的冯康就是其中之一。因为拒绝帮助别人，他决定脱离组织的控制。他一方面寻求陈医生的帮助成为一个普通人，另一方面又变成了一个神秘的“黑衣人”，在城市各处打击犯罪活动。

另一方面，一家负责格斗比赛的公司将动物基因注入他们的身体，以使他们的摔跤运动员更强壮。但这种基因融合有很多弊端，导致被注射者无法随意控制自己的“突变”。其中一个摔跤手变成半人半兽的“蜥蜴怪”后，“黑侠”及时出现击退他。

“黑侠”的出现让公司负责人莫洛克视其为自己最大的眼中钉，于是命令其他摔跤手对付黑侠。制作黑侠的暗影组首领宙斯对他的“背叛”怒不可遏，于是也派了同样是改革家的“008”去抓捕黑侠，甚至用强力的dna炸弹逼他现身。影片最后，黑侠以其敏捷的身手和超强的体力，接连击败了变种人和008，最终还城平安平安。

黑侠第一部电影在北美市场的巨大成功，不仅激发了徐克的创作欲望，也给了投资者花大价钱打造这部《黑侠2》的信心和决心。由于这部电影的主要市场仍然是北美，所以整部电影都是用英语对话来解读的。相比之前的电影，本片的特效场景越来越大，也引入了更多的“转基因”、“基因变异”等科幻元素，尤其是在电视塔上黑侠和蜥蜴怪打架的开场场景，已经有点“超级英雄电影”的意思了。

当时徐克刚从好莱坞回到香港，这段经历也极大地影响了《黑侠2》的创作走向，使其在叙事方式和风格上更加“西化”。

比如《变种人》其实是专门为西方观众拍摄的；安志杰饰演的新版《黑骑士》也缺乏对人物自身“侠义精神”的探讨，更像是“东方骑士”的表面符号；此外，影片对“科幻”的强调远远大于对情节和细节的精心雕琢...也许李连杰的缺席让徐克决定把宝押在一些概念性的东西上，而不是在黑侠第一部的基础上进一步构建一个完整的体系和世界观，这可能是黑侠2最遗憾的地方。

“中国武术第一指”袁和平的表演也让人觉得匪夷所思。整部电影的武打镜头都不好说，关键镜头都记不住。很难相信这是袁和平创造的。当时他正在制作《黑客帝国2》和昆汀的《杀死比尔》，这大概消耗了他所有的精力。