近期研究发现，长江流域抗生素浓度偏高，水生生态系统遭到破坏。调查表明，水中抗生素主要来源于医院和药厂废水、水产品和畜禽养殖废水以及填埋场，在现有工艺下无法有效去除大部分抗生素，导致江湖成为抗生素和耐药性基因库。
抗生素的滥用日益突出，不仅对水生生物具有慢性毒性作用，而且容易产生耐药性，降低人体免疫力。近年来，复旦大学公共卫生学院对数千名8-11岁儿童和516名孕妇进行了调查。结果表明，儿童尿样中检出21种抗生素，79.6%的学龄儿童尿中检出一种或几种抗生素，部分已被临床禁用。兽用抗生素的暴露与儿童肥胖和性早熟有关。此外，江浙沪孕妇尿液中检出16种抗生素，一种或多种抗生素检出率为41.6%。孕妇接触普遍，风险很高。
许多权威专家呼吁尽快将抗生素威胁纳入国家安全监控体系，从源头上严格控制抗生素的使用和排放，加强污染对人体健康影响的研究，提高安全防控水平
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