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zoonotic 【Nature】人兽共患病毒跨种传播的预警研究

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大多数新的人类传染病,如人类免疫缺陷病毒(HIV)、埃博拉病毒和严重急性呼吸系统综合征(SARS),实际上源于野生哺乳动物。因此,有必要特别关注人畜共患病毒。预测哪些病毒最有可能从动物传播给人类,将有助于卫生项目监控新的疾病并防止未来的爆发。

2017年6月21日,《自然》杂志在网上发布了一项名为“宿主和病毒特征预测哺乳动物人畜共患疾病溢出”的研究结果,该研究由美国生态健康联盟(EHA)的研究人员凯文·J·奥利瓦和彼得·达扎克合作进行。利用这个巨大的数据库,研究人员分析了动物携带多种病毒的可能性。在这项研究中,我们分析了影响病毒能否从动物传播到人类的重要因素,并给出了最有可能对人类健康构成新威胁的地理位置,以及哺乳动物物种图。

人畜共患病蔓延的概念模型、病毒丰富度和模型总结

成果概述

在这项研究中,研究人员创建并分析了一个包含2800多种哺乳动物-病毒关系的数据库,这增强了人类对人畜共患病毒跨物种传播影响因素的理解。在分析的586种病毒中,有263种(44.8%)在人体内被检测到。188种病毒(占人类病毒的71.5%)属于人畜共患病毒,即在人类和其他哺乳动物中至少检测过一次的病毒。

通过对哺乳动物宿主-病毒关系的分析,得出了感染特定宿主的各种病毒以及其中可能存在的人畜共患病毒。研究人畜共患病毒从宿主物种传播到人类的风险,因动物与人类的遗传关系、与人类接触的机会以及病毒的特性而异。其中,蝙蝠携带的人畜共患病毒最多,其次是灵长类和啮齿类动物(图1)。

通过对人畜共患病毒地理热点的预测和分析,发现不同宿主的病毒地理格局不同。例如,来自蝙蝠的人畜共患病毒在南美洲、中美洲和亚洲部分地区最为常见;来自灵长类的病毒往往集中在中美洲、非洲和东南亚;来自啮齿动物的病毒在北美、南美和中非更为常见(图2)。

了解野生动物携带病毒的多样性分布和病毒跨物种传播的关键因素是流行病学监测的主要目标。然而,很少有分析工具能够揭示哪些宿主可能携带哪些病毒可能感染人类,或者哪些病毒可能跨越种间屏障。在这项研究的最后,提供了一种新的工具来揭示宿主和人类的进化以及其他病毒特征是重要的预测因子,可以用来评估新病毒是否有感染人类的风险(图3)。

图1 |在哺乳动物中观察到的病毒丰富度。(动物传染病病毒比例的方框图)

图2 |按顺序预测的“失踪人畜共患病”的全球分布

图3 |预测病毒人畜共患潜力的特征

小节

综上所述,本研究建立了6年(2010-2015年)已知感染750种哺乳动物的600种病毒的综合数据库。研究人员使用数学模型来揭示宿主特征和人畜共患病毒之间的相关性。首次明确揭示哺乳动物宿主中的蝙蝠携带的病毒数量最多,可感染人类。

与其他哺乳动物相比,蝙蝠携带感染人类的病毒数量最多,并绘制了最大的潜在感染人类的病毒全球分布图。特别是为评估新发现的病毒是否有感染人类的风险提供了一种新的方法,这不仅有助于识别新的人畜共患病毒,评估其对人类健康的潜在威胁,而且对全球疫情的预警具有重要意义。

相关链接

作为对这项研究的回应,洛杉矶加州大学的詹姆斯·劳埃德·史密斯发表了一篇题为“传染病:病毒跨物种传播的预测”(新闻和观点)的论文。

大多数人类传染病最初是由动物传播的。对所有已知哺乳动物病毒的分析提高了我们对这种跨物种溢出的理解,对公共健康有潜在的益处。

与此同时,《科学》杂志还发表了一篇题为《蝙蝠确实比其他物种携带更危险的病毒》的评论,认为“研究证实,蝙蝠确实比其他动物更危险,可以携带更致命的病毒”。

摘要

宿主和病毒特征可以预测哺乳动物的人畜共患病传播

凯文·奥利瓦尔,帕尔维兹·侯赛尼,卡洛斯·赞布拉纳-托雷利奥,诺姆·罗斯,蒂芙尼·博格奇& amp达塞克

nature(2017)doi:10.1038/nature 22975

大多数人类新发传染病是人畜共患的,特别关注源自野生哺乳动物的病毒(例如,艾滋病毒、埃博拉和非典)1、2、3。因此,了解野生动物中病毒多样性的模式和成功跨物种传播或溢出的决定因素是大流行监测计划的关键目标4。然而,很少有分析工具可以识别哪些宿主物种可能携带下一个人类病毒,或者哪些病毒可以跨越物种界限5,6,7。在这里,我们对哺乳动物宿主-病毒的关系进行了全面的分析,并表明感染给定物种的病毒总数和可能是人畜共患的比例都是可以预测的。在对研究工作进行控制后,每个物种的人畜共患病毒比例是通过物种范围内与人类、宿主分类学和人类种群的系统发生关系来预测的,这可能反映了人类与野生动物的接触。我们证明,蝙蝠比所有其他哺乳动物类拥有更高比例的人畜共患病毒。我们还确定了“缺失病毒”和“缺失人畜共患病”估计数量最大的分类群和地理区域,因此对未来的监测具有最高价值。然后,我们表明系统发育宿主宽度和其他病毒特征是人畜共患潜力的重要预测因素,为评估新发现的哺乳动物病毒是否能感染人类提供了一个新的框架。

原始链接:

http://www . nature . com/nature/journal/vaop/n current/full/nature 22975 . html

相关信息:

1.宿主和病毒特征预测哺乳动物的人畜共患溢出。《自然》,2017年6月21日在线发布,doi:10.1038/nature22975

2.詹姆斯·劳埃德·史密斯。传染病:病毒跨物种传播的预测。《自然》,2017年6月21日在线发布,doi:10.1038/nature23088

3.研究人员确定最有可能携带对人类有风险的病毒的哺乳动物

本期编辑:安娜贝拉

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