（1）粪便的采集
1）采集的粪便务求新鲜，不可混入尿液。
2）一般检查留取少量（5g左右）粪便即可，如为孵化血吸虫毛蚴，应留鸭蛋大小粪便一块，必要时留取24小时粪便。
3）盛粪便的容器要求干燥而清洁，不可有消毒剂和防腐剂，用一次性便盒。做细菌培养时，应采集于灭菌的粪便培养管内送检。
4）采集标本时，应选择带脓血和粘液部分。如无脓血和粘液，可就粪便表面不同部分及粪端采取。如怀疑霍乱患者的粪便标本的采集。
5）肛拭子
用棉花拭子在生理盐水中浸湿，插入肛门2-3cm处，自肛门周围皱襞处拭取，或在肛门口内轻轻旋转涂擦，然后插入盛有生理盐水的试管内。如做粪便拭子培养，以上操作均需使用无菌器材，并将拭子放入灭菌试管。
6）有些检查需要在一定的时间采集标本，如检查蛲虫卵在晚上11时采集较好。有些检查需要特殊的保存条件，如检查溶组织阿米巴滋养体时，除应采集新鲜粪便外，还应注意保温，并立即送检。因此，根据不同检查目的和病原体的特性，应采取不同的采集、保存和运送方式。
（2）粪便的保存与运输
如果不能立即检查，应将粪便标本放入4℃以下保存和带冰运送。如果需要长期保存的标本，应加入少量防腐剂冰冻保存。
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