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【澳洲肺鱼】澳大利亚肺鱼拥有已测序最大动物基因组

资料来源:科学技术日报

科学技术日报北京1月24日电(记者刘霞)英国《新科学家》杂志网站18日发现,奥地利分子病理学研究所的科学家拥有迄今为止测试的所有动物中最大的基因组,其基因组共包含430亿对碱基,是人类基因组的14倍以上。

最新研究负责人齐格弗里德·斯克洛斯宁表示,此前最大已测序动物基因组来自墨西哥两栖动物美西螈。2018年他们对其进行了测序,但澳大利亚肺鱼的基因组比其还大30%。

在最新研究中,科学家们使用高性能计算机测序仪将肺鱼的基因组拼接起来。为解决测序仪可能造成的错误,研究人员使用了基因组的多个拷贝,每个拷贝都被分割成DNA小块。在对所有片段进行测序后,研究小组使用算法将片段重组成一个完整的基因组。斯克洛斯宁估计,得到结果需要计算机处理大约10万小时。

斯克洛斯宁说,澳大利亚肺鱼原产于昆士兰州东南部,该动物从水基生活方式过渡到陆基生活方式以来,其外貌几乎没有什么变化。

此前,科学家们并不清楚肺鱼和腔棘鱼(一种发现于印度洋和印度尼西亚周围的古老鱼类)谁与哺乳动物和鸟类等陆地脊椎动物的关系更密切。新基因组分析明确指出,肺鱼与四足动物的祖先关系更密切。腔棘鱼较早从这些动物中分化出来;而肺鱼在4.2亿年前才与这些动物分道扬镳。

斯克洛斯宁说:“为离开水,肺鱼需要适应陆地的生活方式,必须能呼吸空气,必须能闻到气味。肺鱼背部拥有一个肺,供其呼吸水面上的空气。”

在与肺和关节肢体的发育以及嗅探气味有关基因的数量方面,澳大利亚肺鱼与两栖动物相似。斯克洛斯宁说:“从基因组角度而言,澳大利亚肺鱼的基因组介于鱼类和陆地脊椎动物之间。”

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