mirbase 掀开miRBase序列数据库新面纱

沉寂四年后，miRBase终于在2018年3月12日发布了v22版本。四年后，miRBase数据库发生了哪些变化？会给我们的研究带来怎样的影响？来，我们走近它，看看它的美！

miRBase序列数据库(www.mirbase.org)是一个关于miRNA全方位数据的重要公共数据库，它为研究人员免费提供miRNA序列注释和基因靶点预测等综合信息。

此次更新最显著和最有吸引力的变化是包含的数据大幅增加。根据更新日志，本次更新增加了多达48个新物种，包含的miRNA前体数量从V21版的28，645个增加到38，589个，还包含了来自271个物种的总共48，885个成熟miRNA产品。

新增物种包括向日葵、丹参、黄瓜、草莓等研究中常用的植物，也包括水牛、挖洞兔、鸡等研究中常用的动物。此外，增加了数十个病毒相关序列，极大地丰富了数据库的物种组成。

V21的改版——我的miRNA呢？

类似于参考基因组版本的更新，miRNA序列是不断更新的。此次更新不仅增加了大量序列，还改进了上一版本中包含的许多序列。完善的内容不仅包括修改miRNA的序列，还包括修改miRNA的id，删除不准确的miRNA。如果你想知道难识别的miRNA是否能匹配新版数据库，那就去快速看看新版miRBase数据吧！

根据官方的miRNA.diff修改记录，我们可以看到常见研究物种的更新:

数据集管理技术更新——更多、更快、更完整！

在V22中，miRBase可访问的深度测序数据集数量跃升至831个。MiRBase发言人Sam说，实际上有>:1000个数据集等待添加，但是遇到了技术问题，正在努力解决。到那时，不仅miRBase中深度测序数据的视野会显著扩大，而且被归类为“高度可靠”的microRNA注释的数量也会显著增加。同时，添加功能注释信息和对微小核糖核酸进行序列检索的功能也在开发中。我相信这些新功能可以为研究人员提供更多的帮助。

V22的面纱在这里已经完全揭开。如果你想认识更多的朋友，请在下面留言，我们美丽的工程师会等你的回答。。